10 лет назад создана служба по противодействию коррупции Калининградской областной таможни для противодействия коррупции и обеспечения безопасности таможенных органов. Служба состоит из двух оперативных отделов и одного отделения. За последние 5 лет возбуждено 39 уголовных дел коррупционного характера по материалам службы.
Сотрудники службы ведут оперативно-розыскную, предупредительно-профилактическую и организационно-методическую деятельность по обеспечению безопасности должностных лиц и членов их семей, таможенного дела и таможенных органов.
Также ведется защита информационных ресурсов и их защита от внешних и внутренних угроз.